Skip to main content

Tab af heterozygositet på kromosom 1 og kromosom 19 i primære hjernetumorer

Seniorforsker Kirsten Vang Nielsen, R&D, Dako A/S. E-mail: kirsten.vang@dako.com Overlæge Birgitte Bruun Rasmussen, Patologisk afdeling, Roskilde Sygehus. Overlæge Eva Balslev, Patologisk afdeling, Herlev Hospital. Specialist Tim Svenstrup Poulsen, Molekylær Patologisk afdeling, Dako A/S. Afd. leder Andreas Schønau, Molekylær Patologisk afdeling, Dako A/S. Overlæge Bent Ejlertsen, Onkologisk Klinik, Rigshospitalet

8. jan. 2007
2 min.

I Ugeskrift for Læger beskriver Born et al genetiske forandringer i hjernetumorer ved brug af fluorescens in situhybridisering (FISH)-metoden og hævder dermed at have påvist LOH (loss of heterozygosity) på kromosom 1 og kromosom 19 [1]. Tab af heterozygositet (LOH) opstår ved tab af en ud af to forskellige alleler, fx ved, en allelspecifik mutation, tab af et helt kromosom, en deletion af et kromosomalt område eller en overkrydsning [2]. LOH kan påvises i mange solide tumorer, men da mange tumorer er aneuploide, er valget af metode afgørende [3]. FISH kan detektere både tab (deletion) og gevinst (duplikation eller amplifikation) af en genomisk sekvens svarende til den anvendte probe [4]. Et tab påvist med FISH kan være et tegn på LOH, men da FISH ikke er allelspecifik, kan metoden ikke sikkert påvise LOH.

Erfaringerne med HER2 (ERBB2) viser, at der ofte er afvigelser fra de forventede to signaler, selv i normale celler. Alene skæringen af vævet medfører tab af signaler, fordi snittykkelsen ofte er mindre end kernediameteren. En gevinst af signaler kan fås fra celler under deling, og desuden er cancerceller hyppigt polyploide. Dette kan der tages højde for i analysen ved brug af en referenceprobe, fx en centromerprobe for det relevante kromosom. En ratio mellem gensekvensen og referencen kan herefter beregnes ud fra tællinger i 20-60 celler. FISH er robust og er ved andre kræftsygdomme [5] standardiseret i forhold til den metode Born et al har beskrevet i Ugeskrift for Læger.

Interessekonflikter: Tre af debatørerne er ansat på Dako A/S. Dako forhandler FISH produkter, dog ikke dem der er omtalt i artiklen.


Referencer

  1. Born P, Boholm H, Laursen H. Tab af heterozygositet på kromosom 1 og kromosom 19 i primære hjernetumorer. Ugeskr Læger 2006;168:3813-16.
  2. Schwab M. Encyclopedic reference of cancer. Berlin Heidelberg: Springer; 2001.
  3. O'Connell P. Genetic and cytogenetic analyses of breast cancer yield different perspectives of a complex disease. Breast Cancer Res Treat 2003;78:347-57.
  4. Nielsen KV, Müller S, Poulsen TS, Gabs S, Schonau A. Combined use of PNA and DNA for fluorescence in situ hybridization (FISH). I: Nielsen PE, red. Peptide nucleic acids: Protocols and applications. 2. ed. Norfolk: Horizon Bioscience, 2004:227-60.
  5. Olsen KE, Knudsen H, Rasmussen BB, et al. Amplification of HER2 and TOP2A and deletion of TOP2A genes in breast cancer investigated by new FISH probes. Acta Oncol 2004;43:35-42.