Skip to main content

Classification of bladder cancer by microarray expression profiling - towards a general clinical use of microarrays in cancer diagnostics

Cand.scient. Lars Dyrskjøt Andersen: Forf.s adresse: Molekylær Diagnostisk Laboratorium, Klinisk Biokemisk Afdeling, Skejby Sygehus, DK-8200 Århus N. E-mail-adresse: lars@kba.sks.au. dk Forsvaret finder sted den 24. november 2003 kl. 14.00, Auditorium 3, Auditoriehuset, Aarhus Universitet, Bygning 250, Bartholins Allé, Universitetsparken, Århus C. Bedømmere: Timothy J. Yeatman (USA), Francois Radvanyi (Frankrig) og Søren Laurberg . Vejledere: Cand.scient. Thomas Thykjær Andersen, cand.scient. Mogens Kruhøffer og Torben F. Ørntoft.

1. nov. 2005
2 min.

Ph.d.-afhandlingen er baseret på arbejde udført på Klinisk Biokemisk Afdeling, Skejby Sygehus. Formålet med projektet var at identificere genmarkørsæt (ekspressionssignaturer) til stadieklassifikation og til forudsigelse af sygdomsforløb hos patienter med blærekræft. Til dette blev der anvendt oligonucleotide microarrays (Affymetrix) til screening af store dele af det humane genom i et stort antal blæretumorer. Desuden blev der i arbejdet udviklet egne oligonucleotide microarrays til validering af de fundne markører på nye tumorer.

En 32-geners molekylær Ta-T1-T2+-stadie-classifier blev udviklet på basis af 40 blæretumorer og valideret på yderligere 68 tumorer. Tumorerne blev klassificeret med høj korrelation til den histopatologiske klassifikation. Desuden var classifieren i stand til at identificere Ta-tumorer med progressionspotentiale. Yderligere blev der i arbejdet fundet en 26-geners ekspressionssignatur til forudsigelse af recidivpotentiale, samt en 45-geners ekspressionssignatur til forudsigelse af senere progression. Herudover blev der identificeret en ekspressionssignatur til bestemmelse af tilstedeværelsen af carcinoma in situ-læsioner i blæren.

Microarray-screeningerne har desuden kortlagt mange af genregulationerne associeret med udviklingen af blærekræft. Proteinudtrykket af nogle af de interessante kandidater er blevet valideret på tissue microarrays.

Efter yderligere validering af disse ekspressionssignaturer er det vores håb, at man i fremtiden vil kunne anvende microarray- teknologien til at screene patienter for disse ekspressionssignaturer og på den måde være i stand til at tilbyde bedre behandlingsprogrammer end i dag.