Genregulering i forskellige celletyper er afgørende for deres særlige karakteristika i sundhed og sygdom. Variation af DNA-methylering medfører, at ikke alt DNA udtrykkes ligeligt alle steder og udgør en vigtig del af epigenetisk variation. Dog har feltet været præget af mangelfulde data for DNA-methylering i menneskets normale celler. Et nyt studie fremlægger et stort atlas for DNA-methylering (også kaldet methylomet) i en række normale menneskeceller. Professor, overlæge, dr.med. Stig E. Bojesen og læge, ph.d. Søren Egstrand, Klinisk Biokemisk Afdeling, Herlev og Gentofte Hospital, kommenterer: »Studiet af Loyfer et al publiceret i Nature er den hidtil mest omfattende undersøgelse af hele genomets DNA-methylering for 39 forskellige celletyper fra 205 raske individer. DNA-methyleringen er imponerende konstant for den enkelte celletype, på tværs af individer. Derimod er variationen mellem forskellige celletyper fra samme individ på 4,5%. Eksempelvis udviser hver celletype udtalt hypomethylering af signaturgenerne for den givne celletype, f.eks. glucagon-genet for den pankreatiske alfacelle. Endvidere er der tydelig korrelation mellem methyleringsmønstrene for celletyper, der oprindeligt stammer fra samme embryologiske kimlag. Epigenetisk variation er en fundamental og meget stabil biologisk mekanisme til regulation af de genetiske udtryk. Udover den fascinerende biologiske indsigt kan studiet få klinisk betydning på sigt. Der er tiltagende forskningsmæssig interesse i at måle specifikke methyleringsmønstres association med risiko for eller progression af sygdom. Methyleringsmønstre i leukocytters DNA er påvirkelig af livsstil, f.eks. rygning, og kan måske bruges som risikomarkør for lungekræft. Måling af methyleringsmønstre i små cirkulerende brudstykker af kræftcellers DNA i blod (cellefrit tumor-DNA; ctDNA) er begyndt at nærme sig klinisk praksis mhp. overvågning af recidiv for en kræftsygdom. Med nærværende atlas over cellespecifikke methyleringsmønstre kan det måske i fremtiden også blive muligt at bestemme en ukendt primær tumor ved undersøgelse af patientens ctDNA i blod.
INTERESSEKONFLIKTER: ingen
